Collège
(นักเรียนอายุ 11-15 ปี)
เมื่อจบชั้นประถมศึกษา นักเรียนทุกคนจะเข้าเรียนต่อระดับมัธยมศึกษาตอนต้น (6ème, 5ème, 4ème and 3ème) โดยไม่ต้องผ่านการทดสอบใดๆ
ชั้น 6ème นักเรียนจะใช้ทักษะและความรู้ต่างๆที่สั่งสมจากระดับประถมศึกษา มาสร้างเป็นรากฐาน เพื่อพัฒนาและฝึกฝนการเรียนรู้ในรูปแบบการเรียนการสอนระดับมัธยมศึกษา
ชั้น 5ème และชั้น 4ème นักเรียนจะได้เรียนรู้ทั้งทางทฤษฎีและปฏิบ้ติในเชิงลึก
ชั้น 3ème นักเรียนจะต้องเรียนรู้ให้ครบตามหลักสูตรระดับมัธยมศึกษาตอนต้น เพื่อเตรียมตัวเรียนต่อระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย และในปลายปีการศึกษา นักเรียนจะต้องสอบประกาศนียบัตรมัธยมศึกษาตอนต้น (Diplôme National du Brevet – DNB)
รายวิชาตามหลักสูตร ได้แก่ ภาษาฝรั่งเศส ภาษาและวัฒนธรรมไทย คณิตศาสตร์ ประวัติศาสตร์และภูมิศาสตร์ หน้าที่พลเมืองและจริยธรรม ฟิสิกส์ เคมี และชีววิทยา เทคโนโลยี ศิลปะ ดนตรี และพลศึกษา ภาษาต่างประเทศจะมีความสำคัญมากขึ้น นักเรียนจะต้องเรียนภาษาอังกฤษเป็นภาษาต่างประเทศภาษาที่หนึ่ง เน้นการฝึกพูด เมื่อเข้าเรียนชั้น 5ème นักเรียนจะต้องเลือกเรียนภาษาต่างประเทศภาษาที่สอง ซึ่งโรงเรียนมีเสนอให้เลือก คือ ภาษาเยอรมัน ภาษาสเปน หรือภาษาจีนกลาง
ในระดับมัธยมศึกษาตอนต้นของโรงเรียนฝรั่งเศสนานาชาติ กรุงเทพ นักเรียนจะได้เรียนรู้ในสภาพแวดล้อมที่พิเศษ เพราะจำนวนเฉลี่ยของนักเรียนในแต่ละห้องจะน้อยกว่าระดับมาตรฐานทั่วไป ในต้นปีการศึกษา 2564-2565 มีนักเรียนโดยเฉลี่ยเพียงห้องละ 20 คน
Lycée
(นักเรียนอายุ 15-18 ปี)
การเรียนการสอนระดับมัธยมศึกษาตอนปลายจะแบ่งเป็น 3 ชั้น ได้แก่ Seconde, Première และ Terminale
จาการปฏิรูปหลักสูตรมัธยมศึกษาตอนปลายและประกาศนียบัตร Baccalauréat ครั้งล่าสุด มีการยกเลิกสายวิชา ES, L, S (เศรษฐศาสตร์-สังคมศาสตร์, ภาษาและวรรณคดี, วิทยาศาสตร์) และนำระบบใหม่มาใช้ เมื่อนักเรียนเรียนจบชั้น Seconde (มัธยมศึกษาปีที่ 4) จะเลือกเรียนวิชาเฉพาะ ซึ่งมีให้เลือกทั้งหมด 8 วิชา
และนักเรียนสามารถใช้ภาษาไทยประกอบการสอบ Baccalauréat
จำนวนนักเรียนโดยเฉลี่ยห้องละ 20 คน (ต้นปีการศึกษา 2564-2565) ทั้งในวิชาเลือกและวิชาเฉพาะ ถือเป็นปัจจัยส่งเสริมการเรียนรู้ให้มีประสิทธิภาพ
ในปลายปีการศึกษา 2563-2564 นักเรียนชั้น Terminale สำเร็จการศึกษาและได้รับประกาศนียบัตร Baccalauréat เป็นจำนวน 98%